步入新世纪，上海的发展不断创下新佳绩。尤其是为世博会配套的众多工程，让山海的城市面貌再换了新颜。世博会的成功举办，让世界更加充分地了解中国，目睹中国的巨大变化，加速了中国经济市场化和开放化。

依托于上海国际金融中心定位的进一步巩固，同时，得益于现代设计集团创新转型的发展战略，与注重科技创新和前沿技术的开发运用。在新世纪里，上海院的发展也进入了有史以来发展最快的时期，作为院长，刘恩芳敏锐地预见到技术创新的应用前景，在现代设计集团“技术领先”发展战略引领下，将BIM、绿色技术研究、低碳城市设计等专项研究作为突破口，率先应用到实践中。如今上海院的BIM技术水平在国内同行中“领跑”，对绿色建筑设计的研究也在许多项目中得到推广。上海院在这期间的建筑项目几乎涵盖了上海各种类型的地标性建筑，同时，在刘恩芳力推的“有所为”和“有所不为”的思路引导下，集中优势兵力做出了一个又一个的品牌项目。